Günümüzde Bostancı vapur İskelesinin olduğu yerde, çok eskiden antik bir liman bulunduğu biliniyor. Limanın girişini daraltan uzunca bir taş iskelesinin ucunda 1912-1913 yıllarında inşa edilen bu günkü yığma kâgir iskele Adalar hattı vapurlarının başlangıç noktası bakımından bu kıyının en önemli iskelelerinin başında geliyor.
İskele binası yığma kagir olup üstünde de inşa edildiği yılların modası gereği küçük bir kubbe yer alıyor. 1978’de yenilenen 2006’da İstanbul Büyükşehir Belediyesi tarafından bir kez daha elden geçirildi.
1912 - 1913 tarihleri arasında inşa edilen Bostancı Vapur İskelesi'nin mimarı Mimar Vedat Tek eseri olduğu bilinmektedir.
İskelede dört oda bulunmaktadır. Sağ taraftaki oda bekleme salonu, diğer üç oda ise personel odasıdır. İskelenin mimarisinin en belirgin özelliği dış cephelerde Bursa kemerinin kullanılmış olmasıdır.
Kadıköy - Kartal Metrosuna, otobüs seferlerine, deniz otobüsüne yakınlığıyla merkezi konumda olan Bostancı Vapur İskelesi yoğun olarak kullanılmaktadır. Eminönü ve Adalar seferleri Bostancı Vapur İskelesi'nden yapılmaktadır.
iskelenin sağlı sollu iki yanaşma yeri bulunmaktadır. Biri 56+25, öteki 56+14 metredir. İskelenin sudan yüksekliği 1.5, iskele önünün derinliği 4 metredir.