Dikdörtgen planlı olan açık türbe, Hacılar Ezanı mezarlığının içinde yer almaktadır. İçindeki mermer lahitin kitabesinde, 1573-1574 yıllarında ölen kişinin Mimar Sinan’ın torunu Fatma Hanım olduğu yazmaktadır.
Bir kaide üzerinde altı taşıyıcı ayak üzerine oturan türbenin uzun kenarlarında iki adet sivri, kısa kenarlarında ise birer adet basık kemer bulunmaktadır.
Türbe, taş kaplama kırma çatı ile örtülüdür. Fatma Hanım Türbesi, Mimar Sinan’ın, Süleymaniye Külliyesi içindeki kendi türbesine benzemektedir. Süslemesi olmayan yapı, günümüzde iyi durumdadır.